Kanserde transkripsiyonun düzenlenmesi
Genellikle kansere giden yolda yüzlerce gen susturulur veya aktive edilir. Kanserlerde bazı genlerin susturulması mutasyonla meydana gelmesine rağmen, kanser bağlantılı gen susturulmasının büyük bir kısmı DNA metilasyonunun değişmesinin bir sonucudur (bkz. Kanserde DNA metilasyonu). Kanserde gen susturulmasına neden olan DNA metilasyonu, tipik olarak, protein kodlayan genlerin promotörlerinde bulunan CpG adalarındaki birden çok CpG bölgesinde meydana gelir.
MikroRNA'ların değiştirilmiş anlatımları (ekspresyon) da kansere giden yolda birçok genin susturulmasına veya aktive edilmesine sebep olur (bkz. Kanserde mikroRNA'lar). Değiştirilmiş mikroRNA ekspresyonu, mikroRNA'ların transkripsiyonunu kontrol eden promotörlerde CpG adalarındaki CpG bölgelerinin hiper/hipo-metilasyonu yoluyla meydana gelir.
CpG adalarının promotörleri üzerinden metilasyonu yoluyla DNA onarım genlerinin susturulması, kansere giden yolda önemli görünmektedir (bkz. Kanserde DNA onarım genlerinin metilasyonu).