Protein kütle spektrometrisi
Protein kütle spektrometrisi, kütle spektrometrisinin proteinlerin incelenmesine uygulanmasını ifade eder. Kütle spektrometrisi, proteinlerin doğru kütle tespiti ve karakterizasyonu için önemli bir yöntemdir ve birçok kullanımı için çeşitli yöntemler ve araçlar geliştirilmiştir. Uygulamaları arasında proteinler ve translasyon sonrası modifikasyonlarının tanımlanması, protein komplekslerinin, alt birimlerinin ve fonksiyonel etkileşimlerinin aydınlatılması veproteomikteki proteinlerin küresel ölçümü yer alır. Aynı zamanda proteinlerin çeşitli organellerdeki konumlarını belirlemek ve farklı proteinler ile membran lipidleri arasındaki etkileşimleri belirlemek için de kullanılabilir.[1][2]
Kütle spektrometresinde proteinin iyonizasyonu için kullanılan iki ana yöntem, elektrosprey iyonizasyon (ESI) ve matris destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyonudur (MALDI). Bu iyonizasyon teknikleri, ardışık kütle spektrometresi gibi kütle analizörleri ile birlikte kullanılır. Genel olarak, proteinler ya proteinlerin bozulmadan analiz edildiği " üst-alt " bir yaklaşımla veya proteinin ilk önce parçalara sindirildiği " alt-üst " bir yaklaşımla analiz edilir. Daha büyük peptit fragmanlarının analiz edildiği "orta-aşağı" yaklaşımı da bazen kullanılabilir.
Kaynakça
[değiştir | kaynağı değiştir]- ^ Jürgen Cox and Matthias Mann (Temmuz 2011). "Quantitative, High-Resolution Proteomics for Data-Driven Systems Biology". Annual Review of Biochemistry. 80: 273-299. doi:10.1146/annurev-biochem-061308-093216. PMID 21548781. 8 Kasım 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi13 Ekim 2020.
- ^ Nelson P. Barrera and Carol V. Robinson (Temmuz 2011). "Advances in the Mass Spectrometry of Membrane Proteins: From Individual Proteins to Intact Complexes". Annual Review of Biochemistry. 80: 247-71. doi:10.1146/annurev-biochem-062309-093307. PMID 21548785. – via Annual Reviews (abonelik gereklidir)