Arthrobacter agilis

*Arthrobacter agilis*
Arthrobacter agilis
Korunma durumu
	Değerlendirilmedi (IUCN 3.1)
Biyolojik sınıflandırma
Üst âlem:	Bacteria
Şube:	Actinobacteria
Takım:	Actinomycetales
Familya:	Micrococcaceae
Cins:	Arthrobacter
Tür:	A. agilis
İkili adlandırma
	Arthrobacter agilis Koch et al. 1995
Sinonimler
	Micrococcus agilis

Arthrobacter agilis, Arthrobacter cinsine bağlı fizokrotrofik bir bakteri türüdür.^[3] Anktarktik deniz buzlarında ve göl sularında bulunur.^[4]^[5]^[6]^[7]^[8] Arthrobacter agilis dimetilhekzadesilamin ve karotenoid üretir.^[9]

Hindistan Himalayalar' da bulunan bir buzaltı gölü olan Pangong Gölü'nde izole edilmiştir.^[10] Genom anlizleri canlının metablik çok yönlülüğünü gösteren genlerin ortaya çıkmasını sağladı. Bu genler arasında soğuk şoku adaptasyonu, çeşitli yapısal ve, bitki temelli karbon polimerleri gibi, deposal polisakkaridlerin biyosentezi ve kullanımını gösteren genler vardır. Arthrobacter agilis suş L77 genomu 3,608,439 baz çifti (3.60 Mb) boyutunda bir dairesel kromozomdan ibarettir. of a circular chromosome. Genom 3316 protein kodlayan gen, 74 RNA geni, 725 hipotetik gen, 25 yalancı gen ve 1404 eşsiz gen içerir.^[11] Hidrolitik enzimleri ve soğuk şok proteinleri adayları genomda tespit edilmiştir. Arthrobacter agilis suş L77 gelecek vadeden biyolojik projelerde antifriz proteinlerin, işlevsel enzimlerin ve diğer biyoaktif moleküllerin bir kaynağı olarak hizmet edecektir.^[12]

Konuyla ilgili yayınlar

George M. Garrity (2012). Bergey's manual of systematic bacteriology (2.2yer=New York bas.). Springer Science + Business Media. ISBN 0387682333.
Naveen Kumar Arora (2013). Plant microbe symbiosis : fundamentals and advances. New Delhi: Springer. ISBN 8132212878.
Koki Horikoshi (2011). Extremophiles handbook. Tokyo: Springer. ISBN 4431538976.

Dış bağlantılar

Type strain of Arthrobacter agilis at BacDive - the Bacterial Diversity Metadatabase15 Ağustos 2018 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
Wikimedia Commons'ta Arthrobacter agilis ile ilgili çoklu ortam belgeleri bulunur.
Vikitür'de Arthrobacter agilis ile ilgili ayrıntılı taksonomik bilgiler bulunur.

Kaynakça

^ Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1] 15 Ağustos 2018 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
^ "ATCC". 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018.
^ "ITIS". 30 Ekim 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Haziran 2022.
^ Ulber, vol. ed. Yves Le Gal ; Roldand (2005). Marine biotechnology ([Standing order]. bas.). Berlin: Springer. ISBN 3-540-25669-5.
^ Miller, edited by Robert V.; Whyte, Lyle G. (2012). Polar microbiology : life in a deep freeze. Washington, DC: ASM Press. ISBN 1-55581-604-5. CS1 maint: Extra text: authors list (link)
^ editors, Antonio Ventosa, Aharon Oren, Yanhe Ma, (2011). Halophiles and hypersaline environments current research and future trends. Berlin: Springer. ISBN 3-642-20198-9.
^ Atlas, edited by Asim K. Bej, Jackie Aislabie, Ronald M. (2010). Polar microbiology the ecology, biodiversity, and bioremediation potential of microorganisms in extremely cold environments. Boca Raton: Taylor & Francis. ISBN 1-4200-8388-0. CS1 maint: Extra text: authors list (link)
^ "UniProt". 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018.
^ Velázquez-Becerra, C; Macías-Rodríguez, LI; López-Bucio, J; Flores-Cortez, I; Santoyo, G; Hernández-Soberano, C; Valencia-Cantero, E (Aralık 2013). "The rhizobacterium Arthrobacter agilis produces dimethylhexadecylamine, a compound that inhibits growth of phytopathogenic fungi in vitro". Protoplasma. 250 (6). ss. 1251-62. doi:10.1007/s00709-013-0506-y. PMID 23674267.
^ Yadav, Ajar Nath; Sachan, Shashwati Ghosh; Verma, Priyanka; Tyagi, Satya Prakash; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (5 Kasım 2014). "Culturable diversity and functional annotation of psychrotrophic bacteria from cold desert of Leh Ladakh (India)". World Journal of Microbiology and Biotechnology (İngilizce). 31 (1). ss. 95-108. doi:10.1007/s11274-014-1768-z. ISSN 0959-3993. 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi15 Ağustos 2018.
^ Singh, Ram N.; Gaba, Sonam; Yadav, Ajar N.; Gaur, Prakhar; Gulati, Sneha; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (1 Ocak 2016). "First high quality draft genome sequence of a plant growth promoting and cold active enzyme producing psychrotrophic Arthrobacter agilis strain L77". Standards in Genomic Sciences. Cilt 11. s. 54. doi:10.1186/s40793-016-0176-4. ISSN 1944-3277. PMC 5000428 . PMID 27570579. This content is available under the Creative Commons Attribution License 4.0.
^ "Bacterial diversity of cold deserts and mining of genes for low temperature tolerance (PDF Download Available)". ResearchGate (İngilizce). doi:10.13140/rg.2.1.2948.1283/2. ^{[ölü/kırık bağlantı]}

Arthrobacter ile ilgili bu madde taslak seviyesindedir. Madde içeriğini genişleterek Vikipedi'ye katkı sağlayabilirsiniz.

[DSMZ-1] Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1] 15 Ağustos 2018 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.

[2] "ATCC". 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018.

[ITIS-3] "ITIS". 30 Ekim 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Haziran 2022.

[4] Ulber, vol. ed. Yves Le Gal ; Roldand (2005). Marine biotechnology ([Standing order]. bas.). Berlin: Springer. ISBN 3-540-25669-5.

[5] Miller, edited by Robert V.; Whyte, Lyle G. (2012). Polar microbiology : life in a deep freeze. Washington, DC: ASM Press. ISBN 1-55581-604-5. CS1 maint: Extra text: authors list (link)

[6] tors, Antonio Ventosa, Aharon Oren, Yanhe Ma, (2011). Halophiles and hypersaline environments current research and future trends. Berlin: Springer. ISBN 3-642-20198-9.

[7] Atlas, edited by Asim K. Bej, Jackie Aislabie, Ronald M. (2010). Polar microbiology the ecology, biodiversity, and bioremediation potential of microorganisms in extremely cold environments. Boca Raton: Taylor & Francis. ISBN 1-4200-8388-0. CS1 maint: Extra text: authors list (link)

[8] "UniProt". 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Ağustos 2018.

[9] Velázquez-Becerra, C; Macías-Rodríguez, LI; López-Bucio, J; Flores-Cortez, I; Santoyo, G; Hernández-Soberano, C; Valencia-Cantero, E (Aralık 2013). "The rhizobacterium Arthrobacter agilis produces dimethylhexadecylamine, a compound that inhibits growth of phytopathogenic fungi in vitro". Protoplasma. 250 (6). ss. 1251-62. doi:10.1007/s00709-013-0506-y. PMID 23674267.

[10] Yadav, Ajar Nath; Sachan, Shashwati Ghosh; Verma, Priyanka; Tyagi, Satya Prakash; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (5 Kasım 2014). "Culturable diversity and functional annotation of psychrotrophic bacteria from cold desert of Leh Ladakh (India)". World Journal of Microbiology and Biotechnology (İngilizce). 31 (1). ss. 95-108. doi:10.1007/s11274-014-1768-z. ISSN 0959-3993. 15 Ağustos 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi15 Ağustos 2018.

[11] Singh, Ram N.; Gaba, Sonam; Yadav, Ajar N.; Gaur, Prakhar; Gulati, Sneha; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (1 Ocak 2016). "First high quality draft genome sequence of a plant growth promoting and cold active enzyme producing psychrotrophic Arthrobacter agilis strain L77". Standards in Genomic Sciences. Cilt 11. s. 54. doi:10.1186/s40793-016-0176-4. ISSN 1944-3277. PMC 5000428 . PMID 27570579. This content is available under the Creative Commons Attribution License 4.0.

[12] "Bacterial diversity of cold deserts and mining of genes for low temperature tolerance (PDF Download Available)". ResearchGate (İngilizce). doi:10.13140/rg.2.1.2948.1283/2. ^{[ölü/kırık bağlantı]}

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]