NAMD - Vikipedi
İçeriğe atla
Ana menü
Gezinti
  • Anasayfa
  • Hakkımızda
  • İçindekiler
  • Rastgele madde
  • Seçkin içerik
  • Yakınımdakiler
Katılım
  • Deneme tahtası
  • Köy çeşmesi
  • Son değişiklikler
  • Dosya yükle
  • Topluluk portalı
  • Wikimedia dükkânı
  • Yardım
  • Özel sayfalar
Vikipedi Özgür Ansiklopedi
Ara
  • Bağış yapın
  • Hesap oluştur
  • Oturum aç
  • Bağış yapın
  • Hesap oluştur
  • Oturum aç

İçindekiler

  • Giriş
  • 1 Ayrıca bakınız
  • 2 Kaynakça
  • 3 Dış bağlantılar

NAMD

  • العربية
  • Català
  • Deutsch
  • English
  • Español
  • İtaliano
  • 日本語
  • 한국어
  • Русский
  • Srpskohrvatski / српскохрватски
  • Српски / srpski
Bağlantıları değiştir
  • Madde
  • Tartışma
  • Oku
  • Değiştir
  • Kaynağı değiştir
  • Geçmişi gör
Araçlar
Eylemler
  • Oku
  • Değiştir
  • Kaynağı değiştir
  • Geçmişi gör
Genel
  • Sayfaya bağlantılar
  • İlgili değişiklikler
  • Kalıcı bağlantı
  • Sayfa bilgisi
  • Bu sayfayı kaynak göster
  • Kısaltılmış URL'yi al
  • Karekodu indir
Yazdır/dışa aktar
  • Bir kitap oluştur
  • PDF olarak indir
  • Basılmaya uygun görünüm
Diğer projelerde
  • Wikimedia Commons
  • Vikiveri ögesi
Görünüm
Vikipedi, özgür ansiklopedi
Nanoscale Molecular Dynamics
GeliştiriciUniversity of Illinois at Urbana–Champaign: Teorik ve Hesaplamalı Biyofizik Grubu (Theoretical and Computational Biophysics Group/TCB), Paralel Programlama Labaratuvarı (Parallel Programming Laboratory/PPL)
İlk yayınlanma1995 (30 yıl önce) (1995)
Kod deposu
  • gitlab.com/tcbgUIUC/namd
Bunu Vikiveri'de düzenleyin
Programlama diliC++
İşletim sistemiÇapraz platform: Windows, Linux, macOS, Unix
Platformx86, x86-64
Dillerİngilizce
TürMoleküler dinamik similasyon
Resmî sitesiks.uiuc.edu/Research/namd
Nanoscale Molecular Dynamics (NAMD, önceden Not Another Molecular Dynamics Program),[1] Charm ++ paralel programlama modeli kullanılarak yazılmış moleküler dinamik simülasyonu yazılımıdır . Paralel verimliliği ile ön plandadır ve genellikle büyük sistemleri (milyonlarca atom) simüle etmek için kullanılır.[2] University of Illinois at Urbana–Champaign'nde Teorik ve Hesaplamalı Biyofizik Grubu (TCB) ve Paralel Programlama Laboratuvarı (PPL) işbirliği ile geliştirilmiştir.

NAMD, ticari olmayan amaçlar için ücretsiz olarak mevcuttur.

Ayrıca bakınız

[değiştir | kaynağı değiştir]
  • Charm ++
  • Moleküler mekanik modelleme yazılımları karşılaştırması
  • Ücretsiz ve açık kaynaklı yazılım paketlerinin listesi

Kaynakça

[değiştir | kaynağı değiştir]
  1. ^ "Flexibility and Interoperability in a Parallel Molecular Dynamics Code". 17 Mayıs 2018 tarihinde kaynağından (postscript) arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Mart 2020. 
  2. ^ "NAMD A Parallel Object-Oriented Molecular Dynamics Program" (PDF). 9 Ekim 2006 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Mart 2020. 

Dış bağlantılar

[değiştir | kaynağı değiştir]
  • Resmî site,
  • NAMD page at the PPL website5 Ocak 2007 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • NAMD on GPUs13 Mart 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • g
  • t
  • d
Bilgisayarlı kimya yazılımları
Kemoinformatik
Özgür
  • Avalon Cheminformatics Toolkit
  • Bioclipse
  • Blue Obelisk
  • Chemistry Development Kit
  • ECCE
  • JOELib
  • OELib
  • Open Babel
  • RDKit
Özel mülk
  • Canvas
  • Chemicalize
  • Discovery Studio
Kimyasal kinetik
Özgür
  • APBS
  • Cantera
  • KPP
Özel mülk
  • Autochem
  • Chemical WorkBench
  • CHEMKIN
  • COSILAB
  • DelPhi
  • Khimera
Moleküler modelleme
ve
görselleştirme
Moleküler grafik sistemleri listesi
Özgür
  • Ascalaph Designer
  • Avogadro
  • BALL
  • Biskit
  • Gabedit
  • Ghemical
  • Jmol
  • Molekel
  • PyMOL
  • QuteMol
  • RasMol
Özel mülk
  • Abalone
  • ACD/ChemSketch
  • Atomistix ToolKit
  • ChemDraw
  • ChemWindow
  • EzMol
  • Gaussian
  • Maestro
  • MarvinSketch
  • MarvinView
  • MODELLER
  • Molecular Operating Environment
  • SAMSON
  • Spartan
  • UCSF Chimera
  • VMD
Moleküler yanaştırma
Protein-ligand yanaştırma yazılımları listesi
Özgür
  • AutoDock
  • AutoDock Vina
  • FlexAID
  • rDock
Özel mülk
  • Glide
  • LeDock
  • Molecular Operating Environment
Moleküler dinamik
Özgür
  • CP2K
  • GROMACS
  • LAMMPS
  • OpenMM
  • PLUMED
Özel mülk
  • Abalone
  • AMBER
  • CHARMM
  • CPMD
  • Desmond
  • GROMOS
  • NAMD
Kuantum kimyası
Kuantum kimyası ve katı hal fiziği yazılımları listesi
Özgür
  • ABINIT
  • ACES (CFOUR)
  • AIMAll
  • BigDFT
  • COLUMBUS
  • CONQUEST
  • CP2K
  • Dalton
  • DIRAC
  • DP code
  • FLEUR
  • FreeON
  • MADNESS
  • MOPAC
  • MPQC
  • NWChem
  • Octopus
  • OpenMolcas
  • PARSEC
  • PSI
  • PyQuante
  • PySCF
  • Quantum ESPRESSO (PWscf)
  • RMG
  • SIESTA
  • VB2000
  • YAMBO code
Özel mülk
  • ADF
  • AMPAC
  • DMol3
  • CADPAC
  • CASINO
  • CASTEP
  • CPMD
  • CRUNCH
  • CRYSTAL
  • Firefly
  • GAMESS (UK)
  • GAMESS (US)
  • Gaussian
  • Jaguar
  • MOLCAS
  • MOLPRO
  • ONETEP
  • OpenAtom
  • ORCA
  • PLATO
  • PQS
  • Q-Chem
  • Quantemol
  • Scigress
  • Spartan
  • TeraChem
  • TURBOMOLE
  • VASP
  • WIEN2k
  • XMVB
İskelet yapısı çizimi
Özgür
  • JChemPaint
  • Molsketch
  • XDrawChem
Özel mülk
  • ACD/ChemSketch
  • BIOVIA Draw
  • ChemDoodle
  • ChemDraw
  • ChemWindow
  • JME Molecule Editor
  • MarvinSketch
Diğer
  • Aqion
  • Eulim
  • EXC code
  • GenX
  • GSim
  • Mercury
  • CrystalExplorer
  • ICM (ICM-Browser)
  • Materials Studio
  • Molden
  • OpenChrom
  • SASHIMI
"https://tr.wikipedia.org/w/index.php?title=NAMD&oldid=31668203" sayfasından alınmıştır
Kategori:
  • Bilim yazılımları
Gizli kategoriler:
  • Hiçbir veri sırasıyla bilgi kutusu şablonlarını kullanan maddeler
  • Bilgi alt kutulu maddeler
  • Vikiveri ve Vikipedi üzerindeki resmî site verisi farklı olan sayfalar
  • Webarşiv şablonu wayback bağlantıları
  • Sayfa en son 10.20, 20 Şubat 2024 tarihinde değiştirildi.
  • Metin Creative Commons Atıf-AynıLisanslaPaylaş Lisansı altındadır ve ek koşullar uygulanabilir. Bu siteyi kullanarak Kullanım Şartlarını ve Gizlilik Politikasını kabul etmiş olursunuz.
    Vikipedi® (ve Wikipedia®) kâr amacı gütmeyen kuruluş olan Wikimedia Foundation, Inc. tescilli markasıdır.
  • Gizlilik politikası
  • Vikipedi hakkında
  • Sorumluluk reddi
  • Davranış Kuralları
  • Geliştiriciler
  • İstatistikler
  • Çerez politikası
  • Mobil görünüm
  • Wikimedia Foundation
  • Powered by MediaWiki
NAMD
Konu ekle